scbmtБИОМЕДИЦИНАJournal Biomed2074-59822713-0428Scientific center of biomedical technologies of Federal Medical and Biological Agency10.33647/2074-5982-21-2-8-16scbmt-1711Research ArticleМЕТОДЫ И ТЕХНОЛОГИИ БИОМЕДИЦИНСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙMETHODS AND TECHNOLOGIES OF BIOMEDICAL RESEARCHОпределение видовой принадлежности кроликов породы Советская шиншилла с помощью ПЦР-фрагмента гена цитохрома b с последующим секвенированием продуктов амплификацииSpecies Determination of Soviet Chinchilla Breed Rabbits by PCR of a Cytochrome b Gene Fragment Followed by Sequencing of Amplification ProductsКаркищенкоВ. Н.KarkischenkoV. N.

Каркищенко Владислав Николаевич, д.м.н., проф. 

143442, Московская обл., Красногорский р-н, п. Светлые горы, 1 

Vladislav N. Karkischenko, Dr. Sci. (Med.), Prof. 

143442, Moscow Region, Krasnogorsk District, Svetlye Gory Village, 1

scbmt@yandex.ruПетроваН. В.PetrovaN. V.

Петрова Наталья Владимировна 

143442, Московская обл., Красногорский р-н, п. Светлые горы, 1 

Nataliya V. Petrova 

143442, Moscow Region, Krasnogorsk District, Svetlye Gory Village, 1

m-sklad@yandex.ruСлободенюкВ. В.SlobodenyukV. V.

Слободенюк Владимир Владимирович, к.б.н. 

143442, Московская обл., Красногорский р-н, п. Светлые горы, 1 

Vladimir V. Slobodenyuk, Cand. Sci. (Biol.) 

143442, Moscow Region, Krasnogorsk District, Svetlye Gory Village, 1

prof-v-iprim@mail.ruКолосковаЕ. М.KoloskovaE. M.

Колоскова Елена Михайловна, к.б.н., Всероссийский научно-исследовательский институт физиологии, биохимии и питания животных — филиал 

249013, Калужская обл., Боровск, п. Институт 

Elena M. Koloskova, Cand. Sci. (Biol.) 

249013, Kaluga Region, Borovsk, Institut Village 

heleko3@yandex.ruЛеднёваН. А.LednevaN. A.

Леднёва Надежда Андреевна 

143442, Московская обл., Красногорский р-н, п. Светлые горы, 1 

Nadezhda A. Ledneva 

143442, Moscow Region, Krasnogorsk District, Svetlye Gory Village, 1

kichi09@mail.ruСавинаМ. А.SavinaM. A.

Савина Мария Анатольевна 

143442, Московская обл., Красногорский р-н, п. Светлые горы, 1 

Mariya A. Savina 

143442, Moscow Region, Krasnogorsk District, Svetlye Gory Village, 1

graff22@mail.ruПанинаЕ. В.PaninaE. V.

Панина Елена Витальевна, к.б.н., доц. 

143442, Московская обл., Красногорский р-н, п. Светлые горы, 1 

Elena V. Panina, Cand. Sci. (Biol.), Assoc. Prof.

143442, Moscow Region, Krasnogorsk District, Svetlye Gory Village, 1

epanina@rgau-msha.ruБерзинаА. Г.BerzinaA. G.

Берзина Ася Григорьевна, к.б.н. 

143442, Московская обл., Красногорский р-н, п. Светлые горы, 1 

Asya G. Berzina, Cand. Sci. (Biol.) 

143442, Moscow Region, Krasnogorsk District, Svetlye Gory Village, 1

berzina07@mail.ruФГБУН «Научный центр биомедицинских технологий ФМБА России»РоссияScientific Center of Biomedical Technologies of the Federal Medical and Biological Agency of RussiaRussian FederationВсероссийский научно-исследовательский институт физиологии, биохимии и питания животных — филиал ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства — ВИЖ им. акад. Л.К. Эрнста»РоссияAll-Russian Research Institute of Physiology, Biochemistry and Animal Nutrition — Branch of the Federal Scientific Centre of Animal Husbandry — All-Russian Institute of Animal Husbandry named after Acad. L.K. ErnstRussian Federation202504072025212816Copyright © Каркищенко В.Н., Петрова Н.В., Слободенюк В.В., Колоскова Е.М., Леднёва Н.А., Савина М.А., Панина Е.В., Берзина А.Г., 20252025Каркищенко В.Н., Петрова Н.В., Слободенюк В.В., Колоскова Е.М., Леднёва Н.А., Савина М.А., Панина Е.В., Берзина А.Г.Karkischenko V.N., Petrova N.V., Slobodenyuk V.V., Koloskova E.M., Ledneva N.A., Savina M.A., Panina E.V., Berzina A.G.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.scbmt.ru/jour/article/view/1711

В статье приведены данные об определении пригодности гена CYTB для типирования кроликов породы Советская шиншилла. Детекцию целевого фрагмента гена CYTB проводили с помощью ПЦР в реальном времени с использованием высокоспецифичных праймеров и зонда на амплификаторе, продукт ПЦР использовали в реакции секвенирования по Сэнгеру. В результате эксперимента выяснилось, что ген митохондриального цитохрома b может выступать в качестве маркера генетической оценки чистоты породы кроликов Советская шиншилла и пригодности особей для дальнейшей селекции. Метод секвенирования данного участка гена цитохрома b показал свою эффективность, практическую значимость и позволил за достаточно короткий срок провести скрининг животных для их использования в селекционно-генетической работе или иных исследовательских целях.

The article presents data on determining the suitability of the CYTB gene for typing rabbits of the Soviet Chinchilla breed. The detection of the target site of the CYTB gene was carried out by real-time PCR using highly specific primers and an amplifier probe; the PCR product was used in the Sanger sequencing reaction. The experiment determined that the mitochondrial cytochrome b gene can act as a marker for the genetic assessment of the purity of the Soviet Chinchilla rabbit breed and the suitability of individuals for further breeding. The method of sequencing of this section of the cytochrome b gene showed its efficacy and practical significance, allowing animals to be screened over a fairly short period of time for their use in breeding and genetic work or other research purposes.

кроликисеквенирование по СэнгеруПЦР в реальном временицитохром brabbitsSanger sequencingreal-time PCRcytochrome bReferencesЕзерский В.А., Колоскова Е.М. Генетическая конструкция для замещения гена кислого сывороточного протеина кролика при использовании CRISPR/Cas9 метода. Проблемы биологии продуктивных животных. 2019;4:23–35.Ezerskii V.A., Koloskova E.M. Geneticheskaya konstrukcia dlya zameshenia gena kislogo sivorotochnogo proteina krolika pri ispolsovanii CRISPR/Cas9 metoda [Genetic construction for replacement of rabbit whey acidic protein gene using the CRISPR/Cas9 method]. Problemy biologii produktivnykh zhivotnykh [Problems of biology of productive animals]. 2019;4:23–35. (In Russian).Езерский В.А., Шишиморова М.С., Тевкин С.И., Трубицина Т.П., Колоскова Е.М., Безбородова О.А. и др. Интеграция и тканеспецифическая экспрессия гена лактоферрина человека в молочной железе трансгенных кроликов. Проблемы биологии продуктивных животных. 2013;4:33–52.Ezerskii V.A., Shishimorova M.S., Tevkin S.I., TrubitsinaT.P., Koloskova E.M., Bezborodova O.A., et al. Integratsiyai i tkanespetsificheskaya ekspressiya gena laktoferrina cheloveka v molochnoi zheleze transgennykh krolikov [Integration and tissue-specifi c expression of human lactoferrin gene in mammary gland of transgenic rabbits]. Problemy biologii produktivnykh zhivotnykh [Problems of biology of productive animals]. 2013;4:33–52. (In Russian).Колоскова Е.М., Каркищенко В.Н., Езерский В.А., Петрова Н.В., Максименко С.В., Матвеенко Е.Л. Трансгенные и нокаутные кролики в биомедицине и генотерапии. CRISPR/Cas9-технологии (обзор). Биомедицина. 2019;15(4):12–33. DOI: 10.33647/2074-5982-15-4-12-33.Kolosko-va E.M., Karkischenko V.N., Ezerskii V.A., Petrova N.V., Maksimenko S.V., Transgennie i nokautnie kroliki v biomedicine i genoterapii. CRISPR/Cas9-tehnologii (obzor) [Rabbit biomodels of human diseases developed using new genomic technologies. Crispr/cas9 (review)]. Biomeditsina [Journal Biomed]. 2019;15(4):12–33. (In Russian). DOI: 10.33647/2074-5982-15-4-12-33.Макарова М.Н., Макаров В.Г. Использование кроликов в доклинических исследованиях. Лабораторные животные для научных исследований. 2023;3(6):18–43. [Makarova M.N, Makarov V.G. Ispolzovanie krolikov v doklinicheskih issledovaniah DOI: 10.57034/2618723X-2023-03-0.Makarova M.N, Makarov V.G. Ispolzovanie krolikov v doklinicheskih issledovaniah [Rabbits in preclinical research]. Laboratornie givotnie dlya nauchnih issledovanij [Laboratory animals for science]. 2023;3(6):18–43. (In Russian). DOI: 10.57034/2618723X-2023-03-0.Юращик С.В. Кролиководство. Уч. пособ. для высших учебных заведений. Гродно: УО «ГГАУ», 2005:412.Yurashhik S.V. Krolikovodstvo [Rabbit breeding]. Uch. posob. dlya visshih uchebnih zavedenij [Study guide for higher education institutions]. Grodno: UO “GGAU”, 2005:412 (In Russian).Fan J., Challah M., Watanabe T. Transgenic rabbit models for biomedical research: current status, basic methods and future perspectives. Pathol. Int. 1999;49(7):583–594. DOI: 10.1046/j.1440-1827.1999.00923.x.Fan J., Challah M., Watanabe T. Transgenic rabbit models for biomedical research: current status, basic methods and future perspectives. Pathol. Int. 1999;49(7):583–594. DOI: 10.1046/j.1440-1827.1999.00923.x.Fan J., Wang Y., Chen Y.E. Genetically Modified Rabbits for Cardiovascular Research. Front. Genet. 2021;12:614379. DOI: 10.3389/fgene.2021.614379.Fan J., Wang Y., Chen Y.E. Genetically Modified Rabbits for Cardiovascular Research. Front. Genet. 2021;12:614379. DOI: 10.3389/fgene.2021.614379.Okumura N., Matsumoto D., Fukui Y., Teramoto M., et al. Feasibility of cell-based therapy combined with descemetorhexis for treating Fuchsen do the lialcorneal dystrophy in rabbit model. PLoSOne. 2018;13(1):e0191306. DOI:10.1371/journal.pone. 0191306.Okumura N., Matsumoto D., Fukui Y., Teramoto M., et al. Feasibility of cell-based therapy combined with descemetorhexis for treating Fuchsen do the lialcorneal dystrophy in rabbit model. PLoSOne. 2018;13(1):e0191306. DOI:10.1371/journal.pone. 0191306.Kamaruzaman N.A., Kardia E., Kamaldin N., Latahir A.Z., Yahaya B.H. The rabbit as a model for studying lung disease and stemcelltherapy. Biomed. Res. Int. 2013;691830. DOI: 10.1155/2013/691830.Kamaruzaman N.A., Kardia E., Kamaldin N., Latahir A.Z., Yahaya B.H. The rabbit as a model for studying lung disease and stemcelltherapy. Biomed. Res. Int. 2013;691830. DOI: 10.1155/2013/691830.Kinoshita S., Koizumi N., Ueno M., et al. Injection of cultured cells with a ROCK inhibitor for bullouskerato pathy. N. Engl. J. Med. 2018;378:995–1003.Kinoshita S., Koizumi N., Ueno M., et al. Injection of cultured cells with a ROCK inhibitor for bullouskerato pathy. N. Engl. J. Med. 2018;378:995–1003.Mage R.G., Lanning D., Knight K.L. B cell and antibody repertoire development in rabbits: the requirement of gut-associated lymphoid tissues. Dev. Comp. Immunol. 2006;30(1–2):137–153. DOI: 10.1016/j.dci.2005.06.017.Mage R.G., Lanning D., Knight K.L. B cell and antibody repertoire development in rabbits: the requirement of gut-associated lymphoid tissues. Dev. Comp. Immunol. 2006;30(1–2):137–153. DOI: 10.1016/j.dci.2005.06.017.Mage R.G., Esteves P.J., Rader C. Rabbit models of human diseases for diagnostics and therapeutics development. Dev. Comp. Immunol. 2019;92:99–104. DOI: 10.1016/j.dci.2018.10.003.Mage R.G., Esteves P.J., Rader C. Rabbit models of human diseases for diagnostics and therapeutics development. Dev. Comp. Immunol. 2019;92:99–104. DOI: 10.1016/j.dci.2018.10.003.Sebbag L., Mochel J.P. An eye on the dog as the scientist’s best friend for translation al research in ophthalmology: Focus on the ocular surface. Med. Res. Rev. 2020;40(6):2566–2604. DOI: 10.1002/med.21716.Sebbag L., Mochel J.P. An eye on the dog as the scientist’s best friend for translation al research in ophthalmology: Focus on the ocular surface. Med. Res. Rev. 2020;40(6):2566–2604. DOI: 10.1002/med.21716.Soares J., Pinheiro A., Esteves P.J. The rabbit as an animal model to study innate immunity genes: Is it better than mice? Front. Immunol. 2022;13:981815. DOI: 10.3389/fimmu.2022.981815.Soares J., Pinheiro A., Esteves P.J. The rabbit as an animal model to study innate immunity genes: Is it better than mice? Front. Immunol. 2022;13:981815. DOI: 10.3389/fimmu.2022.981815.Young S., Forsberg-Nilsson K., Good J.M., Lander E.S., et al. Rabbit genome analysis revealsapolygenic basis for phenotypic change during domestication. Science. 2014;346(62000):1074–1079. DOI: 10.1126/science.1253714.Young S., Forsberg-Nilsson K., Good J.M., Lander E.S., et al. Rabbit genome analysis revealsapolygenic basis for phenotypic change during domestication. Science. 2014;346(62000):1074–1079. DOI: 10.1126/science.1253714.Zernii E.Y., Baksheeva V.E., Iomdina E.N., et al. Rabbit Models of Ocular Diseases: New Relevance for Classical Approaches. CNS Neurol. Disord. Drug Targets. 2016;15(3):267–291. DOI: 10.2174/1871527315666151110124957.Zernii E.Y., Baksheeva V.E., Iomdina E.N., et al. Rabbit Models of Ocular Diseases: New Relevance for Classical Approaches. CNS Neurol. Disord. Drug Targets. 2016;15(3):267–291. DOI: 10.2174/1871527315666151110124957.Zhang Z., Liu H., Qian Q., Wang L., Yuan H. Advances in the Isolation of Specific Monoclonal Rabbit Antibodies. Frontiers in Immunology. 2017;8:494. DOI: 10.3389/fimmu.2017.00494.Zhang Z., Liu H., Qian Q., Wang L., Yuan H. Advances in the Isolation of Specific Monoclonal Rabbit Antibodies. Frontiers in Immunology. 2017;8:494. DOI: 10.3389/fimmu.2017.00494.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.