scbmtБИОМЕДИЦИНАJournal Biomed2074-59822713-0428Scientific center of biomedical technologies of Federal Medical and Biological Agencyscbmt-296Research ArticleСтатьиМолекулярные аспекты создания лекарственных препаратов: использование методов компьютерного моделирования с целью создания нового противоишемического средстваMolecular aspects of drug development: using methods of computer modeling to create new anti-ischemic agentsАвенироваЕ. Л.AvenirovaE. L.noemail@neicon.ruАлексееваП. А.AlekseevaP. A.noemail@neicon.ruБарановаН. И.BaranovaN. I.noemail@neicon.ruБассМ. С.BassM. S.noemail@neicon.ruБурякинаА. В.BuryakinaA. V.noemail@neicon.ruПитухинаН. Н.PitukhinaN. N.noemail@neicon.ruФедороваЕ. В.FedorovaE. V.elena.fedorova@pharminnotech.comГБОУ ВПО Санкт-Петербургская химико-фармацевтическая академия, Санкт-ПетербургRussian Federation20142001202011410Copyright © Авенирова Е.Л., Алексеева П.А., Баранова Н.И., Басс М.С., Бурякина А.В., Питухина Н.Н., Федорова Е.В., 20202020Авенирова Е.Л., Алексеева П.А., Баранова Н.И., Басс М.С., Бурякина А.В., Питухина Н.Н., Федорова Е.В.Avenirova E.L., Alekseeva P.A., Baranova N.I., Bass M.S., Buryakina A.V., Pitukhina N.N., Fedorova E.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.scbmt.ru/jour/article/view/296

С помощью компьютерных методов моделирования были проанализированы спектры биологической активности ряда производных малоновой кислоты с целью изыскания потенциально активных соединений в отношении ишемических повреждений миокарда. На основании полученных результатов была проведена оценка взаимодействия наиболее перспективного соединения (4-[(3-этокси-3-оксопропаноил)амино] бензойной кислоты) c А3аденозиновым рецептором методом молекулярного докинга. Установлено, что данное соединение может рассматриваться как перспективное противоишемическое средство.

The spectra of biological activity of several derivatives of malonic acid were analyzed using computer modeling techniques with the aim to identify potentially active compounds against ischemic myocardial injury. The nature of interaction between the most promising compound based on the obtained results (4-[(3-ethoxy-3-oxopropanoyl) amino] benzoic acid) and A3 adenosine receptor was evaluated using molecular docking. Thus this compound can be regarded as a perspective anti-ischemic agent.

молекулярное моделированиевиртуальный скринингнаправленное конструированиепротивоишемические средстваmolecular modelingvirtual screeningrational designanti-ischemic agentsReferencesИщенко Р.О., Федорова Е.В., Яковлев И.П. Фармация. 2013 (5). С. 41-43.Ищенко Р.О., Федорова Е.В., Яковлев И.П. Фармация. 2013 (5). С. 41-43.Brooks B.R., Bruccoleri R.E., Olafson B.D., States D.J., Swaminathan S. Kar- plus M. CHARMM - a program for macromolecular energy, minimization anddynamics calculations // J. Comp. Chem. 1983. № 4. P. 187-188.Brooks B.R., Bruccoleri R.E., Olafson B.D., States D.J., Swaminathan S. Kar- plus M. CHARMM - a program for macromolecular energy, minimization anddynamics calculations // J. Comp. Chem. 1983. № 4. P. 187-188.Gao Z.G., Kim S.K., et al. Structural determinants of A3 adenosine receptor activation-nucleoside ligands at the agonist/antagonist boundary. 2002J. Med. Chem. 45. Р. 4471-4484.Gao Z.G., Kim S.K., et al. Structural determinants of A3 adenosine receptor activation-nucleoside ligands at the agonist/antagonist boundary. 2002J. Med. Chem. 45. Р. 4471-4484.Gao, Z.G., et al. Identification by site-directed mutagenesis of residuesinvolved in ligand recognition and activation of the human A3 adenosine receptor. 2002J. Biol. Chem. 277. Р. 19056-19063.Gao, Z.G., et al. Identification by site-directed mutagenesis of residuesinvolved in ligand recognition and activation of the human A3 adenosine receptor. 2002J. Biol. Chem. 277. Р. 19056-19063.Lagunin A., Stepanchikova A., Filimonov D., Poroikov V. Bioinformatics. 2000. 16 (8). 747 р.Lagunin A., Stepanchikova A., Filimonov D., Poroikov V. Bioinformatics. 2000. 16 (8). 747 р.Li Z., Wan H., Shi Y., Ouyang P. Personal experience with four kinds of chemical structure drawing software: reviewonChemDraw. ChemWindow. ISIS / Draw. and ChemSketch // J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004. Vol. 44. № 5. P. 1886-1890.Li Z., Wan H., Shi Y., Ouyang P. Personal experience with four kinds of chemical structure drawing software: reviewonChemDraw. ChemWindow. ISIS / Draw. and ChemSketch // J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004. Vol. 44. № 5. P. 1886-1890.Sadym A., Lagunin A., Filimonov D., Poroikov V. SAR & QSAR Environ. Res. 2003. 14 (5-6) 339.Sadym A., Lagunin A., Filimonov D., Poroikov V. SAR & QSAR Environ. Res. 2003. 14 (5-6) 339.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.