scbmtБИОМЕДИЦИНАJournal Biomed2074-59822713-0428Scientific center of biomedical technologies of Federal Medical and Biological Agencyscbmt-500Research ArticleГЕНЕТИКАСравнительный анализ однонуклеотидного полиморфизма гена IL28B у больных гепатитом С русских и тувинцевComparative analysis of singe nucleotide polymorphisms of gene IL28B in Russian and Tyvinian patients with hepatitis CНиколаеваЛ. И.NikolaevaL. I.L.I.Nikolaeva@mail.ruЛейбманЕ. А.LeybmanE. A.noemail@neicon.ruГришечкинА. Е.GrishechkinA. E.noemail@neicon.ruСапроновГ. В.SapronovG. V.noemail@neicon.ruКичатоваВ. А.KichatovaV. A.noemail@neicon.ruКожановаТ. В.KozhanovaT. V.noemail@neicon.ruКюрегянК. К.KyuregyanK. K.noemail@neicon.ruМихайловМ. И.MikhaylovM. I.noemail@neicon.ruСарыгларА. А.SaryglarA. A.noemail@neicon.ruФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России, МоскваRussian FederationГБОУ ВПО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова», МоскваRussian FederationФГБУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова» РАН, МоскваRussian FederationГБОУ ДПО «Российская медицинская академия последипломного образования», МоскваRussian FederationГУЧ «Инфекционная больница» Министерства здравоохранения Республики Тыва, г. КызылRussian Federation201521012020125864Copyright © Николаева Л.И., Лейбман Е.А., Гришечкин А.Е., Сапронов Г.В., Кичатова В.А., Кожанова Т.В., Кюрегян К.К., Михайлов М.И., Сарыглар А.А., 20202020Николаева Л.И., Лейбман Е.А., Гришечкин А.Е., Сапронов Г.В., Кичатова В.А., Кожанова Т.В., Кюрегян К.К., Михайлов М.И., Сарыглар А.А.Nikolaeva L.I., Leybman E.A., Grishechkin A.E., Sapronov G.V., Kichatova V.A., Kozhanova T.V., Kyuregyan K.K., Mikhaylov M.I., Saryglar A.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.scbmt.ru/jour/article/view/500

Целью исследования явилось определение прогностически значимых для стандартной двойной терапии однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) около гена IL28B по двум локусам rs12979860 (С>T) и rs8099917 (T>G) у пациентов с хроническим гепатитом С русской (европеоиды) и тувинской (монголоиды) национальности. Определение ОНП выполняли методом ПЦР в режиме реального времени. В локусе rs12979860 достоверно чаще у тувинцев выявлялся С-аллель, а у русских - Т-аллель (р=0,0466). Статистически значимых различий по T- и G-аллелям локуса rs8099917 не выявлено. Генотип С/С по локусу rs1297960 достоверно чаще определялся у тувинцев (р=0,0231), а генотип С/Т - у русских (р=0,0425). Генотип Т/Т по локусу rs8099917 достоверно чаще выявляется у тувинцев (р=0,0259), а генотип Т/G - у русских (р=0,0188). С учетом двух полиморфных локусов, у тувинских пациентов достоверно чаще (р=0,0203) выявлялся генотип С/С (rs12979860) - Т/Т (rs8099917), что дает лучший прогноз на успешное завершение терапии.

The aim of the study was to detect single nucleotide polymorphisms (SNP) near gene IL28B on locus rs12979860 (С>T) and locus rs8099917 (T>G), which are prognostically significant for standard dual therapy in patients with chronic hepatitis C of Russian (Europian) and Tyvinian (Mongoloid) ethnicity. The SNP were discovered by real-time PCA. The Tyvinian patients more frequency showed the C-allele, and Russian patients more frequency displayed Т-allele (p=0.0466). There were no differences in T- and G-alleles on locus rs8099917. The Tyvinian patients more often showed genotype C/C (p=0.0231) and Russian patients more frequency displayed genotype C/Т (p=0.0425) on locus rs1297960. Genotype T/T on locus rs8099917 significantly often detected in Tyvinian patients (p=0.0259) and genotype T/G more frequently detected in Russian patients (p=0.0188). When take in account two polymorphic loci, genotype С/С (rs12979860) - Т/Т (rs8099917) significantly often detected in Tyvinian patients (p=0.0203), this genotype is associated with more ability to get sustained virologic response.

однонуклеотидный полиморфизмген IL28Bгепатит Сэтногенетические различияsinge nucleotide polymorphismsgene IL28Bhepatitis Cethno-genetic differencesReferencesАбдурахманов Д.Т. Перспективы в лечении хронического гепатита С // Клиническая гепатология. 2010. № 15. С. 50-53.Абдурахманов Д.Т. Перспективы в лечении хронического гепатита С // Клиническая гепатология. 2010. № 15. С. 50-53.Арсентьева Н.А., Останкова Ю.В., Любимова Н.Е., Семенов А.В. Полиморфизм гена IL28B у здоровых и больных хроническим вирусным гепатитом С жителей Санкт-Петербурга // Сб. мат-лов конф. «Молекулярная диагностика-2014». - М. 2014. Т. 1. С. 120.Арсентьева Н.А., Останкова Ю.В., Любимова Н.Е., Семенов А.В. Полиморфизм гена IL28B у здоровых и больных хроническим вирусным гепатитом С жителей Санкт-Петербурга // Сб. мат-лов конф. «Молекулярная диагностика-2014». - М. 2014. Т. 1. С. 120.Заматкина Л.Ф., Малов С.И., Суханова Е.В., Санжеева Д.Н., Хойкова О.Ч., Бимбаева Э.С. Результаты исследования полиморфизма гена интерлейкина-28В при хроническом гепатите С // Cб. мат-лов конф. «Молекулярная диагностика-2014». - М. 2014. Т. 1. С. 136-137.Заматкина Л.Ф., Малов С.И., Суханова Е.В., Санжеева Д.Н., Хойкова О.Ч., Бимбаева Э.С. Результаты исследования полиморфизма гена интерлейкина-28В при хроническом гепатите С // Cб. мат-лов конф. «Молекулярная диагностика-2014». - М. 2014. Т. 1. С. 136-137.Николаева Л.И., Колотвин А.В., Самоходская Л.М., Макашова В.В., Токмалаев А.К., Самохвалов Е.И., Альховский С.В. Генетический полиморфизм и эффективность противовирусной терапии при хроническом вирусном гепатите С // Вестник Российского Университета дружбы народов. Серия «Медицина». 2012. № 2. С. 81-88.Николаева Л.И., Колотвин А.В., Самоходская Л.М., Макашова В.В., Токмалаев А.К., Самохвалов Е.И., Альховский С.В. Генетический полиморфизм и эффективность противовирусной терапии при хроническом вирусном гепатите С // Вестник Российского Университета дружбы народов. Серия «Медицина». 2012. № 2. С. 81-88.Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Российской Федерации [Электронный ресурс] / Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях в Российской Федерации. - Режим доступа: http://75.rospotrebnadzor.ru, свободный. Загл. с экрана. - Яз. рус.Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Российской Федерации [Электронный ресурс] / Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях в Российской Федерации. - Режим доступа: http://75.rospotrebnadzor.ru, свободный. Загл. с экрана. - Яз. рус.Asselah T.J., Bieche I., Narguet S., Sabbagh A., Laurendeau I., Ripault M.P., Boyer N., Martinot-Peignoux M., Valla D., Vidaud M., Marcellin P. Liver gene expression signature is predict response to pegylated interferon plus ribavirin combination therapy in patients with chronic hepatitis C // Gut. 2008. V. 57. P. 516-524.Asselah T.J., Bieche I., Narguet S., Sabbagh A., Laurendeau I., Ripault M.P., Boyer N., Martinot-Peignoux M., Valla D., Vidaud M., Marcellin P. Liver gene expression signature is predict response to pegylated interferon plus ribavirin combination therapy in patients with chronic hepatitis C // Gut. 2008. V. 57. P. 516-524.Ge D., Fellay J., Thompson A.J., Simon J.S., Shianna K.V., Urban T.J., Heinzen E.L., Qiu P., Bertelsen A.H., Muir A.J., Sulkowski M., McHutchison J.G., Goldstein D.B. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance // Nature. 2009. V. 461. P. 399-401.Ge D., Fellay J., Thompson A.J., Simon J.S., Shianna K.V., Urban T.J., Heinzen E.L., Qiu P., Bertelsen A.H., Muir A.J., Sulkowski M., McHutchison J.G., Goldstein D.B. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance // Nature. 2009. V. 461. P. 399-401.Hiramine S., Sugiyama M., Furusyo N., Uto H., Ido A., Tsubouchi H., Watanabe H., Ueno Y., Korenaga M., Murata K., Masaki N., Hayashi J., Thomas D.L., Mizokami M. A thymine-adenine dinucleotide repeat polymorphism near IL28B is associated with spontaneous clearance of hepatitis C virus // J. Gastroenterol. 2015. (PubMed information - до выхода в печать).Hiramine S., Sugiyama M., Furusyo N., Uto H., Ido A., Tsubouchi H., Watanabe H., Ueno Y., Korenaga M., Murata K., Masaki N., Hayashi J., Thomas D.L., Mizokami M. A thymine-adenine dinucleotide repeat polymorphism near IL28B is associated with spontaneous clearance of hepatitis C virus // J. Gastroenterol. 2015. (PubMed information - до выхода в печать).Kaczor M.P., Seczyńska M., Szczeklik W., Sanak M. IL28B polymorphism (rs12979860) associated with clearance of HCV infection in Poland: Systematic review of its prevalence in chronic hepatitis C patients and general population frequency // Pharmacol. Rep. 2015. V. 67. P. 260-266.Kaczor M.P., Seczyńska M., Szczeklik W., Sanak M. IL28B polymorphism (rs12979860) associated with clearance of HCV infection in Poland: Systematic review of its prevalence in chronic hepatitis C patients and general population frequency // Pharmacol. Rep. 2015. V. 67. P. 260-266.Li S., Hu P., Zhang Q.Q., Liu Y.H., Hu H.D., Zhang D.Z., Ren H. Single nucleotide polymorphisms of the IL28B and sustained virologic response of patients with chronic hepatitis C to PEG-interferon/ribavirin therapy: A meta-analysis: Meta-analysis of IL28B // Hepat. Mon. 2011. V. 11. P. 163-172.Li S., Hu P., Zhang Q.Q., Liu Y.H., Hu H.D., Zhang D.Z., Ren H. Single nucleotide polymorphisms of the IL28B and sustained virologic response of patients with chronic hepatitis C to PEG-interferon/ribavirin therapy: A meta-analysis: Meta-analysis of IL28B // Hepat. Mon. 2011. V. 11. P. 163-172.Marcello T., Grakoui A., Barba-Spaeth G., Machlin E.S., Kotenko S.V., MacDonald M.R., Rice C.M. Interferon alpha and lambda inhibit hepatitis C virus replication with distinct signal transduction and gene regulation kinetics // Gastroenterology. 2006. V. 131. P. 1887-1898.Marcello T., Grakoui A., Barba-Spaeth G., Machlin E.S., Kotenko S.V., MacDonald M.R., Rice C.M. Interferon alpha and lambda inhibit hepatitis C virus replication with distinct signal transduction and gene regulation kinetics // Gastroenterology. 2006. V. 131. P. 1887-1898.Sinn D.H., Kim Y.L., Lee S.T., Gwak G.Y., Choi M.S., Lee J.H., Koh K.C., Yoo B.C., Paik S.W. Association of a single nucleotide polymorphism near the interleukin-28B gene with response to hepatitis C virus in Asian patients // J. Gastroenterol. Hepatol. 2011. V. 26. P. 1374-1349.Sinn D.H., Kim Y.L., Lee S.T., Gwak G.Y., Choi M.S., Lee J.H., Koh K.C., Yoo B.C., Paik S.W. Association of a single nucleotide polymorphism near the interleukin-28B gene with response to hepatitis C virus in Asian patients // J. Gastroenterol. Hepatol. 2011. V. 26. P. 1374-1349.Suppiah V., Moldovan M., Ahlenstied G., Berg T., Weltman M., Abate M.L., et al. IL28B is associated with response to chronic hepatitis C interferon-alpha and ribavirin therapy // Nat. Genet. 2009. V. 41. P. 1100-1104.Suppiah V., Moldovan M., Ahlenstied G., Berg T., Weltman M., Abate M.L., et al. IL28B is associated with response to chronic hepatitis C interferon-alpha and ribavirin therapy // Nat. Genet. 2009. V. 41. P. 1100-1104.Tanaka Y., Nishida N., Sugiyama M., Matsuura K., Sakamoto N., Nakagawa M., Korenaga M., Hino K., Hige S., Ito Y., Mita E., Tanaka E., Mochida S., Murawaki Y., Honda M., Sakai A., Hiasa Y., Nishiguchi S., Koike A., Sakaida I., Imamura M., Ito K., Yano K., Masaki N., Sugauchi F., Izumi N., Tokunaga K., Mizokami M. Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-alpha and ribavirin therapy for chronic hepatitis C // Nat. Genet. 2009. V. 41. P. 1105-1109.Tanaka Y., Nishida N., Sugiyama M., Matsuura K., Sakamoto N., Nakagawa M., Korenaga M., Hino K., Hige S., Ito Y., Mita E., Tanaka E., Mochida S., Murawaki Y., Honda M., Sakai A., Hiasa Y., Nishiguchi S., Koike A., Sakaida I., Imamura M., Ito K., Yano K., Masaki N., Sugauchi F., Izumi N., Tokunaga K., Mizokami M. Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-alpha and ribavirin therapy for chronic hepatitis C // Nat. Genet. 2009. V. 41. P. 1105-1109.Thomas D.L., Thio C.L., Martin M.P., Qi Y., Ge D., O’Huigin C., Kidd J., Kidd K., Khakoo S.I., Alexander G., Goedert J.J., Kirk G.D., Donfield S.M., Rosen H.R., Tobler L.H., Busch M.P., McHutchison J.G., Goldstein D.B., Carrington M. Genetic variation in IL28B and spontaneous clearance of hepatitis C virus // Nature. 2009. V. 461. P. 798-801.Thomas D.L., Thio C.L., Martin M.P., Qi Y., Ge D., O’Huigin C., Kidd J., Kidd K., Khakoo S.I., Alexander G., Goedert J.J., Kirk G.D., Donfield S.M., Rosen H.R., Tobler L.H., Busch M.P., McHutchison J.G., Goldstein D.B., Carrington M. Genetic variation in IL28B and spontaneous clearance of hepatitis C virus // Nature. 2009. V. 461. P. 798-801.Younossi Z.M., Birerdinc A., Ester M., Stepanova M., Afendy A., Baranova A. The impact of IL28B genotype on the gene expression profile of patients with chronic hepatitis C treated with pegylated interferon alpha and ribavirin // J. Translational Medicine. 2012. V. 10. P. 25-35.Younossi Z.M., Birerdinc A., Ester M., Stepanova M., Afendy A., Baranova A. The impact of IL28B genotype on the gene expression profile of patients with chronic hepatitis C treated with pegylated interferon alpha and ribavirin // J. Translational Medicine. 2012. V. 10. P. 25-35.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.