Генотипирование линий мышей по гену TPH2 в рутинной практике: выбор методики выделения ДНК для проведения ПЦР
https://doi.org/10.33647/2713-0428-17-3E-48-52
Аннотация
Для использования биомоделей с нокаутом гена TPH2 в экспериментах ключевым моментом является разработка быстрого и высокоточного протокола генотипирования. В настоящее время генотипирование мутантных мышей проводится с помощью методов, включающих секвенирование или многоступенчатую ПЦР, являющиеся дорогостоящими и занимающими продолжительное время. В работе приведён сравнительный анализ двух методов: с помощью детекции продуктов амплификации гель-электрофореграммой и ПЦР в реальном времени. Также рассмотрена процедура выделения ДНК из фрагментов хвостов мышей.
Об авторах
К. А. Курбаков
ФГБНУ «Федеральный научный центр пищевых систем им. В.М. Горбатова» РАН
Россия
Россия
109316, Москва, ул. Талалихина, 26
А. А. Кибиткина
ФГБНУ «Федеральный научный центр пищевых систем им. В.М. Горбатова» РАН
Россия
Россия
109316, Москва, ул. Талалихина, 26
Л. В. Федулова
ФГБНУ «Федеральный научный центр пищевых систем им. В.М. Горбатова» РАН
Россия
Россия
к.т.н.,
109316, Москва, ул. Талалихина, 26
Е. Р. Василевская
ФГБНУ «Федеральный научный центр пищевых систем им. В.М. Горбатова» РАН
Россия
Россия
к.т.н.,
109316, Москва, ул. Талалихина, 26
Г. С. Толмачева
ФГБНУ «Федеральный научный центр пищевых систем им. В.М. Горбатова» РАН
Россия
Россия
109316, Москва, ул. Талалихина, 26
Список литературы
1. Петрова Е.С. Поддержание генетически модифицированных линий мышей: вклад в развитие биоколлекций в России. Лабораторные животные для научных исследований. 2018;2:2–15. DOI: 10.29926/2618723X-2018- 02 01.
2. Auth C.S., Weidner M.T., Strekalova T. Differential anxiety-related behaviours and brain activation in Tph2-deficient female mice exposed to adverse early environment. European Neuropsychopharmacology. 2018;12:19–30. DOI: 10.1016/j.euroneuro.2018.07.103.
3. DNeasy® Blood & Tissue Handbook. QIAGEN, Hilden, Germany. 2006;1–62.
4. Gutknecht L., Araragi N., Merker S., Waider J., Sommerlandt F.M., Mlinar B., Baccini G., Mayer U., Proft F., Hamon M., Schmitt A.G., Corradetti R., Lanfumey L., Lesch K.P. Impacts of brain serotonin deficiency following Tph2 inactivation on development and raphe neuron serotonergic specification. PLoS One. 2012;7(8):e43157. DOI: 10.1371/journal.pone.0043157.
5. Gutknecht L., et al. Deficiency of brain 5-HT synthesis but serotonergic neuron formation in Tph2 knockout mice. J. Neural Transm. (Vienna). 2008;115(8):1127– 1132. DOI: 10.1007/s00702-008-0096-6.
6. Minaev M.Y., Solodovnikova G.I., Kurbakov K.A. Selection of DNA matrix for justification of threshold for contamination of proceed meet products with undeclared poultry components. Theory and practice of meat processing. 2017;2(1):27–36. DOI: 10.21323/2414-438X-2017-2-1-27-36.
7. Otaño-Rivera V., Boakye A., Grobe N., Almutairi M.M., Kursan S., Mattis L.K., Castrop H., Gurley S.B., Elased K.M., Boivin G.P., Di Fulvio M. A highly efficient strategy to determine genotypes of genetically-engineered mice using genomic DNA purified from hair roots. Lab. Anim. 2017;51(2):138– 146. DOI: 1177/0023677216646088.
8. Pratelli M., Pasqualetti M. Serotonergic neurotransmission manipulation for the understanding of brain development and function: Learning from Tph2 genetic models. Biochimie. 2018;45:234–342. DOI: 10.1016/j.biochi.2018.11.016.
9. Wang Z., Storm D.R. Extraction of DNA from mouse tails. Biotechniques. 2006;41(4):410–412. DOI: 10.2144/000112255.
10. Wheeler A., et al. Comparison of DNA yield and STR success rates from different tissues in embalmed bodies. Int. J. of Legal Medicine. 2017;131(1):61–66. DOI: 10.1007/s00414-016-1405-5.
Рецензия
Для цитирования:
Курбаков К.А., Кибиткина А.А., Федулова Л.В., Василевская Е.Р., Толмачева Г.С. Генотипирование линий мышей по гену TPH2 в рутинной практике: выбор методики выделения ДНК для проведения ПЦР. БИОМЕДИЦИНА. 2021;17(3E):48-52. https://doi.org/10.33647/2713-0428-17-3E-48-52
For citation:
Kurbakov K.A., Kibitkina A.A., Fedilova L.V., Vasilevskaya E.R., Tolmacheva G.S. Genotyping of mice lines for the TPH2 gene in routine practice: selection of a DNA extraction technique for PCR. Journal Biomed. 2021;17(3E):48-52. (In Russ.) https://doi.org/10.33647/2713-0428-17-3E-48-52
Просмотров:
431
Послать статью по эл. почте 
