In silico анализ стабильности рибосомного белка S1 из различных штаммов патогенного микроорганизма Staphylococcus aureus
https://doi.org/10.33647/2074-5982-20-3-32-36
- Р Р‡.МессенРТвЂВВВВВВВВжер
- РћРТвЂВВВВВВВВнокласснРСвЂВВВВВВВВРєРСвЂВВВВВВВВ
- LiveJournal
- Telegram
- ВКонтакте
- РЎРєРѕРїРСвЂВВВВВВВВровать ссылку
Полный текст:
Аннотация
Патогенный микроорганизм Staphylococcus aureus, один из представителей семейства стафилококков, способен вырабатывать устойчивость к антибиотикам и антисептикам. Самый большой рибосомный белок S1 из S. aureus содержит четыре структурных S1-домена, при этом короткие пептиды, синтезированные на основе его последовательности, обладают амилоидогенными и антимикробными свойствами (антимикробные пептиды). В данной работе in silico анализ всех доступных последовательностей рибосомного белка S1 из различных штаммов S. aureus позволил выявить остатки, являющиеся характерными для конкретных штаммов. На основе данных сервиса I-Mutant были спрогнозированы изменения стабильности рибосомного белка S1 из различных штаммов S. aureus. Полученные результаты в дальнейшем будут использоваться для целенаправленных мутаций при дизайне новых антимикробных пептидов на основе рибосомного белка S1.
Об авторах
О. В. ГалзитскаяРоссия
Галзитская Оксана Валериановна, д.ф.-м.н.
142290, Московская обл., Пущино, ул. Институтская, 4
142290, Московская обл., Пущино, ул. Институтская, 3
А. В. Мачулин
Россия
Мачулин Андрей Валериевич, к.б.н.
142290, Московская обл., Пущино, просп. Науки, 5
Е. И. Дерюшева
Россия
Дерюшева Евгения Игоревна, к.ф.-м.н.
142290, Московская обл., Пущино, просп. Науки, 3
Список литературы
1. Galzitskaya O.V., Kurpe S.R., Panfilov A.V., Glyakina A.V., Grishin S.Y., Kochetov A.P., Deryusheva E.I., Machulin A.V., Kravchenko S.V., Domnin P.A., Surin A.K., Azev V.N., Ermolaeva S.A. Amyloidogenic peptides: New class of antimicrobial peptides with the novel mechanism of activity. Int. J. Mol. Sci. 2022;23(10):5463. https://doi.org/10.3390/ijms23105463
2. Kourtis A.P., Hatfield K., Baggs J., Mu Y., See I., Epson E., Nadle J., Kainer M.A., Dumyati G., Petit S., Ray S.M.; Emerging Infections Program MRSA author group; Ham D., Capers C., Ewing H., Coffin N., MMWR. Morb. Mortal. Wkly. Rep. 2019;68(9):214-219. https://doi.org/10.15585/mmwr.mm6809e1
3. Machulin A., Deryusheva E.I., Selivanova O.M., Galzitskaya O.V. The number of domains in the ribosomal protein S1 as a hallmark of the phylogenetic grouping of bacteria. PLoS One. 2019;14(8):e0221370. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0221370
4. Sierra J.M., Viñas M. Future prospects for antimicrobial peptide development: Peptidomimetics and antimicrobial combinations. Expert Opin. Drug Discov. 2021;16(6):601-604. https://doi.org/10.1080/17460441.2021.1892072
Рецензия
Для цитирования:
Галзитская О.В., Мачулин А.В., Дерюшева Е.И. In silico анализ стабильности рибосомного белка S1 из различных штаммов патогенного микроорганизма Staphylococcus aureus. БИОМЕДИЦИНА. 2024;20(3):32-36. https://doi.org/10.33647/2074-5982-20-3-32-36
For citation:
Galzitskaya O.V., Machulin A.V., Deryusheva E.I. In silico Analysis of the Stability of Ribosomal Protein S1 from Various Strains of the Pathogenic Microorganism Staphylococcus aureus. Journal Biomed. 2024;20(3):32-36. (In Russ.) https://doi.org/10.33647/2074-5982-20-3-32-36
ISSN 2713-0428 (Online)