Компьютерный дизайн ингибиторов протеинкиназы MST1 - прямого регулятора апоптоза β-клеток
Аннотация
С целью поиска активных соединений, способных оказывать ингибирующее действие на протеинкиназу MST1 (Mammaliansterile 20-like kinase 1) мы провели компьютерный дизайн, применяя методы, основанные на структуре макромолекулы-мишени (Target-Based Drug Design), и методы, основанные на структуре лигандов (Ligand-Based Drug Design). Для оценки нежелательных эффектов использовали программу PASS (Prediction of Activity Spectra for Substances), для построения количественных зависимостей «структура-активность» QSAR (Quantitative Structure-Activity Relationship) и оценки ингибирующей активности компьютерную программу GUSAR (General Unrestricted Structure-Activity Relationships). В результате эксперимента было отобрано 6 потенциальных ингибиторов MST1, относящихся к различным классам органических соединений.
Ключевые слова
сахарный диабет,
ингибиторы MST1,
insilico,
QSAR,
PASS,
GUSAR,
diabetes mellitus,
inhibitors of MST1,
insilico,
QSAR,
PASS,
GUSAR
Об авторах
К. М. Пац
ГБОУ ВПО Санкт-Петербургская химико-фармацевтическая академия, Санкт-Петербург
Россия
Россия
Е. В. Федорова
ГБОУ ВПО Санкт-Петербургская химико-фармацевтическая академия, Санкт-Петербург
Россия
Россия
M. S. Johnson
Aboakademi university, Turku, Finland
Россия
Россия
Li Xiang-Guo
University of Turku and Turku PET Centre, Turku, Finland
Россия
Россия
Список литературы
1. Баранова Н.И., Алексеева П.А., Чистяков К.С., Юсковец В.Н., Оковитый С.В., Бурякина А.В., Федорова Е.В. Поиск синтетических антикоагулянтов - ингибиторов сериновых протеаз: сочетание in silico и in vitro методов // Биомедицина. 2014. № 2. C. 17-24.
2. Пекарева Е.В., Никонова Т.В., Смирнова О.М. Роль апоптоза в патогенезе сахарного диабета 1 типа // Сахарный диабет. 2010. № 1. С. 45-49.
3. Akita S., Umezawa N., Kato N., Higuchi T. Array-based fluorescence assay for serine/threonine kinases using specific chemical reaction // Bioorg Med Chem. 2008. V16. № 16. P. 7788-94.
4. Anand R., Maksimoska J., Pagano N., Wong E.Y., Gimotty P.A., Diamond S.L., Meggers E., Marmorstein R. Toward the Development of a Potent and Selective Organoruthenium Mammalian Sterile 20 Kinase Inhibitor // J. Med. Chem. 2009. № 52. P. 1602-1611.
5. Ardestani A., Paroni F., Azizi Z., Kaur S., Khobragade V., Yuan T., Frogne T., Tao W., Oberholzer J., Pattou F., Kerr J. Conte & Kathrin Maedler Nature Medicine. 2014. № 20. P. 385-397.
6. Fedorova E., Buryakina A., Zakharov A., Filimonov D., Lagunin A., Poroikov V. Design Synthesis and Pharmacological Evaluation of Novel Vanadium-Containing Complexes as Antidiabetic Agents // PloS one. 2014. DOI10.1371 / Journal. pone. 0100386.
7. Fedorova E.V., Buryakina A.V., Vorobieva N.M., Baranova N.I. The vanadium compounds: Chemistry, synthesis, insulinomimetic properties // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2013. V. 7 (4). P. 259-270.
8. Filimonov D.A., Lagunin A.A., Gloriozova T.A., Rudik A.V., Druzhilovskii D.S., Pogodin P.V., Poroikov V.V. Prediction of the biological activity spectra of organic compounds using the PASS online web resource // Chemistry of Heterocyclic Compounds. 2014. № 50 (3). P. 444-457.
9. Filimonov D.A., Zakharov A.V., Lagunin A.A., Poroikov V.V. QNA based 'Star Track' QSAR approach // SAR QSAR Environ. Res. 2009. № 20. P.679-709.
10. Lagunin A., Zakharov A., Filimonov D., Poroikov V. QSAR Modelling of Rat Acute Toxicity on the Basis of PASS Prediction // Mol. Informatics. 2011. № 30 (2-3). P. 241-250.
Для цитирования:
Пац К.М., Федорова Е.В., Johnson M.S., Xiang-Guo L. Компьютерный дизайн ингибиторов протеинкиназы MST1 - прямого регулятора апоптоза β-клеток. БИОМЕДИЦИНА. 2015;1(1):11-17.
For citation:
Pats K.M., Fedorova E.V., Johnson M.S., Li X. Computer design og inhibitors of proteinkinase MST1 - the key regulator of apoptosis of β-cells. Journal Biomed. 2015;1(1):11-17. (In Russ.)
Просмотров: 51
Послать статью по эл. почте 