Опыт генотипирования коллекции макак-резусов по генам класса I главного комплекса гистосовместимости
https://doi.org/10.33647/2074-5982-20-3-21-27
Аннотация
Полезность биомодели в доклинических исследованиях зависит от полноты знаний о ней. Нечеловекообразные приматы — единственная из близких к человеку биомоделей, доступных для доклинической оценки биотехнологических продуктов. Отсутствие иммуногенетических характеристик используемых приматов существенно ограничивает возможности анализа полученных результатов. Наличие сведений о гаплотипе главного комплекса гистосовместимости (major histocompatibility complex, MHC) повышает ценность биомодели. Генотипирование приматов по локусу MHC путём анализа ДНК исключено, поскольку представленность отдельных белков MHC зависит не от их присутствия в геноме биомодели, а от уровня экспрессии в клетках. Поэтому генотипирование приматов по локусу MHC проводят путём анализа мРНК, кодирующих аллельные варианты белков. В представленной работе приведены результаты генотипирования выборки макак-резусов из коллекции Курчатовского комплекса медицинской приматологии с использованием технологии секвенирования следующего поколения на секвенаторе IonProton.
При поддержке: Работа выполнена в рамках гранта Министерства науки и высшего образования Российской Федерации № 075-15-2021-1065.
Об авторах
С. В. Орлов
Курчатовский комплекс медицинской приматологии, НИЦ «Курчатовский институт»
Россия
Россия
Орлов Сергей Владимирович, д.м.н., проф., член-корр. РАН
354376, Сочи, Адлерский р-н, с. Весёлое, ул. Мира, стр. 177
А. А. Агумава
Курчатовский комплекс медицинской приматологии, НИЦ «Курчатовский институт»
Россия
Россия
Агумава Аслан Анзорович, к.б.н.
354376, Сочи, Адлерский р-н, с. Весёлое, ул. Мира, стр. 177
И. Д. Курдюков
ФГУП «Научно-исследовательский институт гигиены, профпатологии и экологии человека» ФМБА России
Россия
Россия
Курдюков Иван Дмитриевич
188663, Ленинградская обл., Всеволожский м/р-н, г.п. Кузьмоловский, ул. Заводская, зд. 6/2, корп. 93
П. П. Бельтюков
ФГУП «Научно-исследовательский институт гигиены, профпатологии и экологии человека» ФМБА России
Россия
Россия
Бельтюков Пётр Петрович, к.м.н., доц.
188663, Ленинградская обл., Всеволожский м/р-н, г.п. Кузьмоловский, ул. Заводская, зд. 6/2, корп. 93
Список литературы
1. Котова Е.С., Каныгина А.В., Желанкин А.В., Бабенко В.В., Болдырева Д.И., Генерозов Э.В., Шарова Е.И. Генотипирование макак-резусов по генам главного комплекса гистосовместимости Mamu-A и Mamu-B с использованием нанопорового секвенирования. В сб.: III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике». Новосибирск: Академиздат, 2022:122.
2. Budde M.L., Lhost J.J., Burwitz B.J., Becker E.A., Burns C.M., O’Connor S.L., Karl J.A., Wiseman R.W., Bimber B.N., Zhang G.L., Hildebrand W., Brusic V., O’Connor D.H. Transcriptionally abundant major histocompatibility complex class I alleles are fundamental to nonhuman primate simian immunodeficiency virus-specific CD8+ T cell responses. J. Virol. 2011;85(7):3250–3261. DOI: 10.1128/JVI.02355-10
3. Hickman-Miller H.D., Bardet W., Gilb A., Luis A.D., Jackson K.W., Watkins D.I., Hildebrand W.H. Rhesus macaque MHC class I molecules present HLA-Blike peptides. J. Immunol. 2005;175(1):367–375. DOI: 10.4049/jimmunol.175.1.367
4. Karl J.A., Bohn P.S., Wiseman R.W., Nimityongskul F.A., Lank S.M., Starrett G.J., O’Connor D.H. Major histocompatibility complex class I haplotype diversity in Chinese rhesus macaques. G3 (Bethesda). 2013;3(7):1195–1201. DOI: 10.1534/g3.113.006254
5. Loffredo J.T., Sidney J., Bean A.T., Beal D.R., Bardet W., Wahl A., Hawkins O.E., Piaskowski S., Wilson N.A., Hildebrand W.H., Watkins D.I., Sette A. Two MHC class I molecules associated with elite control of immunodeficiency virus replication, Mamu-B*08 and HLA-B*2705, bind peptides with sequence similarity. J. Immunol. 2009;182(12):7763– 7775. DOI: 10.4049/jimmunol.0900111
6. Maness N.J. The importance of understanding MHC-I diversity in nonhuman primate models of human infectious diseases. Toxicol. Pathol. 2017;45(1):157–160. DOI: 10.1177/0192623316672072
7. Otting N., Heijmans C.M., Noort R.C., de Groot N.G., Doxiadis G.G., van Rood J.J., Watkins D.I., Bontrop R.E. Unparalleled complexity of the MHC class I region in rhesus macaques. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005;102(5):1626–1631. DOI: 10.1073/pnas.0409084102
8. Rogers J. Genomic resourses for rhesus macaques (Macaca mulatta). Mammalian Genome. 2022;33:91–99. DOI: 10.1007/s00335-021-09922-z
9. Wiseman R.W., Karl J.A., Bimber B.N., O’Leary C.E., Lank S.M., Tuscher J.J., Detmer A.M., Bouffard P., Levenkova N., Turcotte C.L., Szekeres E. Jr., Wright C., Harkins T., O’Connor D.H. Major histocompatibility complex genotyping with massively parallel pyrosequencing. Nature Medicine. 2009;15(11):1322–1326. DOI: 10.1038/nm.2038
Рецензия
Для цитирования:
Орлов С.В., Агумава А.А., Курдюков И.Д., Бельтюков П.П. Опыт генотипирования коллекции макак-резусов по генам класса I главного комплекса гистосовместимости. БИОМЕДИЦИНА. 2024;20(3):21-27. https://doi.org/10.33647/2074-5982-20-3-21-27
For citation:
Orlov S.V., Agumava A.A., Kurdyukov I.D., Beltyukov P.P. Experience of Genotyping of the Class 1 Major Histocompatibility Complex Genes in a Rhesus Macaques Collection. Journal Biomed. 2024;20(3):21-27. (In Russ.) https://doi.org/10.33647/2074-5982-20-3-21-27
Просмотров:
93
Послать статью по эл. почте 
